Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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RxraP28700 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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