Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.5 ms