Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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