Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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