Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms