Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Msra-204ENSMUST00000210363 1042 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 A230001M10Rik-202ENSMUST00000196720 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 AC123867.1-201ENSMUST00000224990 816 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms