Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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