Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms