Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm7910-201ENSMUST00000117896 835 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Rfxank-201ENSMUST00000075724 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Rnf19a-203ENSMUST00000228358 3452 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Spen-201ENSMUST00000078886 12082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Wdr48-201ENSMUST00000036561 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Arpp21-201ENSMUST00000035085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rsph6aQ8CDR2 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms