Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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Atg4aQ8C9S8 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Atg4aQ8C9S8 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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Atg4aQ8C9S8 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
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