Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gga3Q8BMI3 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms