Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ChfrQ810L3 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms