Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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