Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TrioQ0KL02 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms