Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm13081-201ENSMUST00000121527 5599 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Specc1-207ENSMUST00000201364 4955 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Top2aQ01320 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms