Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms