Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprmP28828 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
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