Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm17258-201ENSMUST00000168462 1266 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Irf1P15314 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Rufy3-207ENSMUST00000199312 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Irf1P15314 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Irf1P15314 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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Irf1P15314 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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Irf1P15314 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm8407-201ENSMUST00000192719 427 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Irf1P15314 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms