Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Gm20830J3KML6 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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