Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms