Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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