Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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