Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms