Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Use1Q9CQ56 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Use1Q9CQ56 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Use1Q9CQ56 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Use1Q9CQ56 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Use1Q9CQ56 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Use1Q9CQ56 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Use1Q9CQ56 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Use1Q9CQ56 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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