Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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