Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nup88Q8CEC0 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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