Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Actn1Q7TPR4 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms