Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Banf2os-202ENSMUST00000145504 386 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 1700066J03Rik-202ENSMUST00000224280 516 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms