Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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