Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms