Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm32569-201ENSMUST00000193955 604 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm40040-201ENSMUST00000196123 504 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm42429-201ENSMUST00000198579 558 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm34418-201ENSMUST00000212879 309 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Tead1-206ENSMUST00000164363 1495 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm11722-201ENSMUST00000138702 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm17188-202ENSMUST00000165178 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 4933406F09Rik-202ENSMUST00000180508 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms