Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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H2-M1F7CXU4 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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