Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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Spocd1B1ASB6 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Spocd1B1ASB6 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Spocd1B1ASB6 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Spocd1B1ASB6 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Spocd1B1ASB6 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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