Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms