Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CtcflA2APF3 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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