Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Olfr1532-ps1-203ENSMUST00000215949 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Dhx30-204ENSMUST00000196171 3885 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 F630040K05Rik-201ENSMUST00000180519 2841 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Trub1-202ENSMUST00000026073 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Rapgef4-202ENSMUST00000090826 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gprc5c-202ENSMUST00000053361 3667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr237-ps1-202ENSMUST00000215911 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Selenok-ps7-201ENSMUST00000197069 283 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Prg4-202ENSMUST00000111901 3495 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Mef2a-208ENSMUST00000156690 5538 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Cenpi-202ENSMUST00000101251 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Numb-204ENSMUST00000117217 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm8049-201ENSMUST00000214336 1782 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Cd300e-201ENSMUST00000062787 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Akap8-201ENSMUST00000002699 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Sltm-201ENSMUST00000049263 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Utp14a-201ENSMUST00000080713 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Myo1f-201ENSMUST00000087605 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Dgkg-202ENSMUST00000089925 3555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Fhl1-205ENSMUST00000114773 2298 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm13466-201ENSMUST00000121515 999 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm20388-201ENSMUST00000127664 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms