Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms