Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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