Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms