Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NischQ80TM9 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms