Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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NipblQ6KCD5 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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NipblQ6KCD5 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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NipblQ6KCD5 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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NipblQ6KCD5 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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NipblQ6KCD5 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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NipblQ6KCD5 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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NipblQ6KCD5 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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NipblQ6KCD5 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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NipblQ6KCD5 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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