Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Bank1-203ENSMUST00000196159 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Abcd3-204ENSMUST00000197383 3156 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42966-201ENSMUST00000197883 1691 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15826-201ENSMUST00000121328 1384 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Kdm2b-205ENSMUST00000121739 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Slc1a1-201ENSMUST00000025875 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Ppip5k1-203ENSMUST00000110626 5171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44087-201ENSMUST00000204247 1770 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Syt17-201ENSMUST00000081574 2764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 AC160118.1-201ENSMUST00000214497 2457 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46404-201ENSMUST00000221461 4114 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Slc2a12-201ENSMUST00000042261 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Epb41l3-215ENSMUST00000225977 3188 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr85-203ENSMUST00000115492 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Brpf1-201ENSMUST00000113117 4540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr411-203ENSMUST00000214769 2545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Ddb2-202ENSMUST00000111352 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef38-203ENSMUST00000161022 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Nr2e1-202ENSMUST00000105498 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl25-204ENSMUST00000110982 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 1700092C02Rik-201ENSMUST00000134397 359 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6822-201ENSMUST00000161440 307 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Fxyd2-201ENSMUST00000041005 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Rabep1-204ENSMUST00000108533 2791 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc37-201ENSMUST00000091466 5381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Rhbdf2-201ENSMUST00000103028 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Oprl1-202ENSMUST00000108763 2971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Hsp90ab1-201ENSMUST00000024739 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Sv2b-201ENSMUST00000085164 5307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 D3Ertd751e-203ENSMUST00000108065 3452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Prps1l1-201ENSMUST00000134550 1676 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42575-201ENSMUST00000202942 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Supt20-211ENSMUST00000200441 2154 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Crxos-202ENSMUST00000125993 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25594-201ENSMUST00000102274 82 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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