Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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