Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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PrkcqQ02111 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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PrkcqQ02111 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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