Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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