Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SbdsP70122 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SbdsP70122 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms