Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
VdrP48281 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
VdrP48281 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
VdrP48281 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
VdrP48281 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
VdrP48281 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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VdrP48281 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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VdrP48281 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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