Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms