Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
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PtprmP28828 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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PtprmP28828 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
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PtprmP28828 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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PtprmP28828 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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PtprmP28828 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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PtprmP28828 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprmP28828 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
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PtprmP28828 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
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PtprmP28828 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprmP28828 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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PtprmP28828 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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PtprmP28828 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
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PtprmP28828 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
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PtprmP28828 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
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PtprmP28828 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
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PtprmP28828 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
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PtprmP28828 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
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