Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RxraP28700 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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